El impacto que tuvo en la relación que mantenían los indígenas ópatas con las autoridades hispanas, ante la nueva situación creada por la crisis de la monarquía hispánica a partir de 1808, la cual condujo a la guerra civil en la Nueva España, fueron los temas centrales de la participación del doctor José Marcos Medina Bustos en el III Congreso Internacional de Pueblos Indígenas de América Latina (CIPIAL), realizado en Brasilia, Brasil.